Protein–RNA interactions for Protein: Q05AC5

4930430A15Rik, RIKEN cDNA 4930430A15, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930430A15RikQ05AC5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930430A15RikQ05AC5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930430A15RikQ05AC5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930430A15RikQ05AC5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930430A15RikQ05AC5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930430A15RikQ05AC5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms