Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 URA6YKL024C 615 nt13.08□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 PAU21YOR394W 495 nt13.07□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 PAU22YPL282C 495 nt13.07□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 GRH1YDR517W 1119 nt13.06□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 OXA1YER154W 1209 nt13.06□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 YOR343CYOR343C 327 nt13.05□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 THP3YPR045C 1413 nt13.05□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 SER2YGR208W 930 nt13.04□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 KAE1YKR038C 1161 nt13.04□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 RCR1YBR005W 642 nt13.03□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 RPL12BYDR418W 498 nt13.02□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 BOR1YNL275W 1731 nt13.01□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 ENO2YHR174W 1314 nt13.01□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 YPS3YLR121C 1527 nt13□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 YDR455CYDR455C 309 nt13□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 SPP2YOR148C 558 nt13□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt12.98□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 TAT2YOL020W 1779 nt12.97□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 HTS1YPR033C 1641 nt12.96□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 BET2YPR176C 978 nt12.96□□□□□ -0.33
PDR12Q02785 BIO5YNR056C 1686 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR12Q02785 MFG1YDL233W 1377 nt12.95□□□□□ -0.34
PDR12Q02785 HEM13YDR044W 987 nt12.93□□□□□ -0.34
PDR12Q02785 FMS1YMR020W 1527 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR12Q02785 ERG13YML126C 1476 nt12.92□□□□□ -0.34
PDR12Q02785 HOG1YLR113W 1308 nt12.89□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 TPC1YGR096W 945 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 HRA1HRA1 564 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 CYC3YAL039C 810 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 YOR268CYOR268C 399 nt12.88□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 CWC15YDR163W 528 nt12.86□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 YKR012CYKR012C 378 nt12.86□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 EMC3YKL207W 762 nt12.83□□□□□ -0.35
PDR12Q02785 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 YMR206WYMR206W 942 nt12.83□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 DIG1YPL049C 1359 nt12.82□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 ERO1YML130C 1692 nt12.81□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 YJL067WYJL067W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 OPI3YJR073C 621 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 FSH2YMR222C 672 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 ZRT3YKL175W 1512 nt12.8□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 SUP51tL(UAA)J 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt12.79□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 TVP23YDR084C 600 nt12.78□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 YGR210CYGR210C 1236 nt12.78□□□□□ -0.36
PDR12Q02785 SRP102YKL154W 735 nt12.76□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 YLR280CYLR280C 351 nt12.75□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 RRT8YOL048C 1029 nt12.74□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 NAM8YHR086W 1572 nt12.74□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 SDH8YBR269C 417 nt12.73□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 AMF1YOR378W 1548 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 SDS24YBR214W 1584 nt12.71□□□□□ -0.37
PDR12Q02785 AIM1YAL046C 357 nt12.71□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 YMR210WYMR210W 1350 nt12.71□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 YJL160CYJL160C 864 nt12.7□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 TOS1YBR162C 1368 nt12.7□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 YNR064CYNR064C 873 nt12.69□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 ENO1YGR254W 1314 nt12.69□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 PET18YCR020C 648 nt12.67□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 EDC2YER035W 438 nt12.66□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 BAP3YDR046C 1815 nt12.66□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 ACH1YBL015W 1581 nt12.65□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 PRE5YMR314W 705 nt12.65□□□□□ -0.38
PDR12Q02785 REX2YLR059C 810 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 YPL108WYPL108W 507 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 LEU2YCL018W 1095 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 YPL247CYPL247C 1572 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 ELO1YJL196C 933 nt12.62□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 VPS62YGR141W 1404 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 UTR5YEL035C 501 nt12.61□□□□□ -0.39
PDR12Q02785 ELP4YPL101W 1371 nt12.58□□□□□ -0.4
PDR12Q02785 SAC7YDR389W 1965 nt12.57□□□□□ -0.4
PDR12Q02785 MRP1YDR347W 966 nt12.56□□□□□ -0.4
PDR12Q02785 LSB6YJL100W 1824 nt12.54□□□□□ -0.4
PDR12Q02785 VBA3YCL069W 1377 nt12.54□□□□□ -0.4
PDR12Q02785 LSP1YPL004C 1026 nt12.5□□□□□ -0.41
PDR12Q02785 ADA2YDR448W 1305 nt12.49□□□□□ -0.41
PDR12Q02785 YDL086WYDL086W 822 nt12.47□□□□□ -0.41
PDR12Q02785 YJR149WYJR149W 1215 nt12.47□□□□□ -0.41
PDR12Q02785 NAR1YNL240C 1476 nt12.43□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 SWT21YNL187W 1074 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 YAT1YAR035W 2064 nt12.42□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 YLR046CYLR046C 813 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 RIM2YBR192W 1134 nt12.41□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 GDH1YOR375C 1365 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 PBP1YGR178C 2169 nt12.4□□□□□ -0.42
PDR12Q02785 ALG12YNR030W 1656 nt12.39□□□□□ -0.43
PDR12Q02785 YKL053WYKL053W 375 nt12.39□□□□□ -0.43
PDR12Q02785 YMR166CYMR166C 1107 nt12.37□□□□□ -0.43
PDR12Q02785 SRP54YPR088C 1626 nt12.36□□□□□ -0.43
PDR12Q02785 MET1YKR069W 1782 nt12.35□□□□□ -0.43
PDR12Q02785 SFL1YOR140W 2301 nt12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms