Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfra1P97785 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra1P97785 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra1P97785 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra1P97785 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gfra1P97785 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gfra1P97785 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms