Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmsP97355 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SmsP97355 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SmsP97355 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmsP97355 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmsP97355 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmsP97355 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SmsP97355 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmsP97355 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmsP97355 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmsP97355 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmsP97355 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmsP97355 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SmsP97355 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmsP97355 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmsP97355 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SmsP97355 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmsP97355 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmsP97355 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmsP97355 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmsP97355 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmsP97355 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmsP97355 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmsP97355 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SmsP97355 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmsP97355 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmsP97355 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmsP97355 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmsP97355 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmsP97355 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmsP97355 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmsP97355 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmsP97355 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmsP97355 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmsP97355 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmsP97355 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmsP97355 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmsP97355 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmsP97355 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmsP97355 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmsP97355 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmsP97355 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmsP97355 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmsP97355 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmsP97355 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmsP97355 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmsP97355 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmsP97355 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmsP97355 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmsP97355 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmsP97355 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmsP97355 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmsP97355 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmsP97355 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmsP97355 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmsP97355 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmsP97355 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmsP97355 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmsP97355 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmsP97355 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmsP97355 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmsP97355 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmsP97355 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmsP97355 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmsP97355 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmsP97355 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmsP97355 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SmsP97355 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmsP97355 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmsP97355 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmsP97355 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmsP97355 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmsP97355 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmsP97355 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmsP97355 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmsP97355 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmsP97355 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmsP97355 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmsP97355 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmsP97355 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmsP97355 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmsP97355 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmsP97355 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SmsP97355 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmsP97355 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmsP97355 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmsP97355 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmsP97355 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmsP97355 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms