Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vgll3P85442 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vgll3P85442 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vgll3P85442 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vgll3P85442 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vgll3P85442 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vgll3P85442 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vgll3P85442 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms