Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NfixP70257 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NfixP70257 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NfixP70257 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NfixP70257 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NfixP70257 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NfixP70257 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NfixP70257 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NfixP70257 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NfixP70257 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NfixP70257 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NfixP70257 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NfixP70257 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NfixP70257 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NfixP70257 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NfixP70257 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NfixP70257 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NfixP70257 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NfixP70257 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NfixP70257 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NfixP70257 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NfixP70257 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NfixP70257 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NfixP70257 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NfixP70257 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NfixP70257 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NfixP70257 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NfixP70257 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NfixP70257 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NfixP70257 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NfixP70257 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NfixP70257 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NfixP70257 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NfixP70257 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NfixP70257 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NfixP70257 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NfixP70257 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NfixP70257 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NfixP70257 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NfixP70257 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NfixP70257 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NfixP70257 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NfixP70257 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NfixP70257 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NfixP70257 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NfixP70257 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NfixP70257 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfixP70257 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfixP70257 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfixP70257 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NfixP70257 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NfixP70257 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NfixP70257 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NfixP70257 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NfixP70257 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NfixP70257 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NfixP70257 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NfixP70257 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NfixP70257 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NfixP70257 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NfixP70257 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NfixP70257 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NfixP70257 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NfixP70257 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NfixP70257 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NfixP70257 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NfixP70257 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NfixP70257 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfixP70257 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NfixP70257 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NfixP70257 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NfixP70257 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NfixP70257 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NfixP70257 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NfixP70257 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NfixP70257 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfixP70257 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NfixP70257 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfixP70257 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NfixP70257 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NfixP70257 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NfixP70257 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NfixP70257 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NfixP70257 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NfixP70257 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NfixP70257 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NfixP70257 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NfixP70257 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NfixP70257 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NfixP70257 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NfixP70257 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NfixP70257 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NfixP70257 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NfixP70257 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NfixP70257 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms