Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plxna1P70206 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plxna1P70206 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxna1P70206 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxna1P70206 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plxna1P70206 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plxna1P70206 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plxna1P70206 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms