Protein–RNA interactions for Protein: P57096

Psca, Prostate stem cell antigen, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PscaP57096 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PscaP57096 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PscaP57096 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PscaP57096 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PscaP57096 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PscaP57096 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PscaP57096 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PscaP57096 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PscaP57096 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PscaP57096 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PscaP57096 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PscaP57096 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PscaP57096 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PscaP57096 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PscaP57096 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PscaP57096 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PscaP57096 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PscaP57096 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PscaP57096 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PscaP57096 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PscaP57096 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PscaP57096 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PscaP57096 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PscaP57096 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PscaP57096 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PscaP57096 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PscaP57096 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PscaP57096 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PscaP57096 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PscaP57096 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PscaP57096 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PscaP57096 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PscaP57096 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PscaP57096 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PscaP57096 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PscaP57096 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PscaP57096 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PscaP57096 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PscaP57096 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PscaP57096 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PscaP57096 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PscaP57096 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PscaP57096 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PscaP57096 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PscaP57096 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PscaP57096 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PscaP57096 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PscaP57096 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PscaP57096 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PscaP57096 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PscaP57096 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PscaP57096 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PscaP57096 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PscaP57096 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PscaP57096 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PscaP57096 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PscaP57096 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PscaP57096 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PscaP57096 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PscaP57096 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PscaP57096 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PscaP57096 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PscaP57096 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PscaP57096 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PscaP57096 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PscaP57096 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PscaP57096 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PscaP57096 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PscaP57096 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PscaP57096 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PscaP57096 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PscaP57096 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PscaP57096 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PscaP57096 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PscaP57096 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PscaP57096 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PscaP57096 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PscaP57096 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PscaP57096 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PscaP57096 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PscaP57096 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PscaP57096 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PscaP57096 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms