Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh5P55284 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh5P55284 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh5P55284 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh5P55284 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh5P55284 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh5P55284 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms