Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdh5P55284 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdh5P55284 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdh5P55284 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cdh5P55284 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cdh5P55284 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cdh5P55284 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdh5P55284 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdh5P55284 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdh5P55284 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Cdh5P55284 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdh5P55284 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdh5P55284 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdh5P55284 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdh5P55284 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdh5P55284 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdh5P55284 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdh5P55284 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdh5P55284 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdh5P55284 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdh5P55284 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdh5P55284 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdh5P55284 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdh5P55284 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdh5P55284 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdh5P55284 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdh5P55284 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdh5P55284 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdh5P55284 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdh5P55284 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh5P55284 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdh5P55284 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdh5P55284 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh5P55284 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdh5P55284 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh5P55284 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh5P55284 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdh5P55284 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdh5P55284 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdh5P55284 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh5P55284 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh5P55284 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdh5P55284 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdh5P55284 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdh5P55284 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh5P55284 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdh5P55284 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh5P55284 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdh5P55284 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdh5P55284 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh5P55284 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh5P55284 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdh5P55284 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh5P55284 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh5P55284 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh5P55284 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdh5P55284 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh5P55284 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdh5P55284 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh5P55284 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdh5P55284 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh5P55284 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh5P55284 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh5P55284 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdh5P55284 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh5P55284 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh5P55284 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh5P55284 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdh5P55284 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdh5P55284 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdh5P55284 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdh5P55284 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdh5P55284 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdh5P55284 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdh5P55284 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh5P55284 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh5P55284 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdh5P55284 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdh5P55284 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdh5P55284 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh5P55284 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh5P55284 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdh5P55284 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh5P55284 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh5P55284 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh5P55284 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdh5P55284 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh5P55284 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdh5P55284 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh5P55284 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh5P55284 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdh5P55284 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh5P55284 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh5P55284 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh5P55284 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms