Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bmp8bP55105 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmp8bP55105 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bmp8bP55105 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmp8bP55105 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp8bP55105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp8bP55105 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms