Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cux1P53564 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cux1P53564 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cux1P53564 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cux1P53564 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cux1P53564 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cux1P53564 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux1P53564 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cux1P53564 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cux1P53564 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cux1P53564 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cux1P53564 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cux1P53564 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Cux1P53564 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cux1P53564 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cux1P53564 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cux1P53564 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Cux1P53564 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cux1P53564 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux1P53564 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux1P53564 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux1P53564 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cux1P53564 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Cux1P53564 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cux1P53564 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cux1P53564 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cux1P53564 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cux1P53564 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cux1P53564 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cux1P53564 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cux1P53564 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cux1P53564 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cux1P53564 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cux1P53564 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms