Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cdk11bP24788 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cdk11bP24788 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cdk11bP24788 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cdk11bP24788 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Cdk11bP24788 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cdk11bP24788 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cdk11bP24788 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cdk11bP24788 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Cdk11bP24788 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cdk11bP24788 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cdk11bP24788 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cdk11bP24788 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cdk11bP24788 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cdk11bP24788 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Cdk11bP24788 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cdk11bP24788 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cdk11bP24788 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cdk11bP24788 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cdk11bP24788 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cdk11bP24788 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cdk11bP24788 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cdk11bP24788 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cdk11bP24788 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms