Protein–RNA interactions for Protein: P11214

Plat, Tissue-type plasminogen activator, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlatP11214 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PlatP11214 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PlatP11214 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PlatP11214 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PlatP11214 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PlatP11214 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PlatP11214 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PlatP11214 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PlatP11214 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PlatP11214 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PlatP11214 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PlatP11214 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PlatP11214 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PlatP11214 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PlatP11214 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PlatP11214 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PlatP11214 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PlatP11214 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PlatP11214 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PlatP11214 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PlatP11214 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PlatP11214 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PlatP11214 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PlatP11214 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PlatP11214 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PlatP11214 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PlatP11214 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PlatP11214 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PlatP11214 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PlatP11214 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PlatP11214 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PlatP11214 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PlatP11214 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PlatP11214 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PlatP11214 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PlatP11214 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PlatP11214 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PlatP11214 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PlatP11214 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PlatP11214 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PlatP11214 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PlatP11214 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PlatP11214 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PlatP11214 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PlatP11214 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PlatP11214 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PlatP11214 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PlatP11214 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PlatP11214 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PlatP11214 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PlatP11214 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PlatP11214 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PlatP11214 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PlatP11214 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PlatP11214 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PlatP11214 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PlatP11214 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PlatP11214 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PlatP11214 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PlatP11214 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PlatP11214 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PlatP11214 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PlatP11214 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PlatP11214 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PlatP11214 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PlatP11214 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PlatP11214 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PlatP11214 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PlatP11214 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PlatP11214 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PlatP11214 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PlatP11214 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PlatP11214 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PlatP11214 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PlatP11214 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PlatP11214 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PlatP11214 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PlatP11214 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms