Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NclP09405 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NclP09405 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NclP09405 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NclP09405 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NclP09405 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NclP09405 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NclP09405 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NclP09405 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NclP09405 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NclP09405 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NclP09405 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NclP09405 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NclP09405 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NclP09405 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NclP09405 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NclP09405 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NclP09405 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NclP09405 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NclP09405 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NclP09405 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NclP09405 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NclP09405 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NclP09405 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NclP09405 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NclP09405 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NclP09405 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NclP09405 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NclP09405 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NclP09405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NclP09405 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NclP09405 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NclP09405 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NclP09405 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NclP09405 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NclP09405 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NclP09405 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NclP09405 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NclP09405 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NclP09405 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NclP09405 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NclP09405 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NclP09405 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NclP09405 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NclP09405 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NclP09405 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NclP09405 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NclP09405 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NclP09405 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NclP09405 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NclP09405 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NclP09405 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NclP09405 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NclP09405 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NclP09405 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NclP09405 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NclP09405 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NclP09405 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NclP09405 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NclP09405 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NclP09405 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NclP09405 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NclP09405 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NclP09405 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NclP09405 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NclP09405 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NclP09405 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NclP09405 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NclP09405 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NclP09405 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NclP09405 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NclP09405 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NclP09405 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NclP09405 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NclP09405 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NclP09405 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NclP09405 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NclP09405 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NclP09405 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NclP09405 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NclP09405 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NclP09405 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NclP09405 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NclP09405 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NclP09405 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NclP09405 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NclP09405 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NclP09405 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NclP09405 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NclP09405 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NclP09405 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NclP09405 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NclP09405 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NclP09405 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NclP09405 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms