Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema3fO88632 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema3fO88632 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sema3fO88632 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema3fO88632 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema3fO88632 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema3fO88632 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sema3fO88632 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms