Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc4O35988 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc4O35988 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sdc4O35988 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sdc4O35988 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc4O35988 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc4O35988 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc4O35988 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc4O35988 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms