Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd2O35392 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxd2O35392 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxd2O35392 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd2O35392 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd2O35392 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxd2O35392 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd2O35392 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms