Protein–RNA interactions for Protein: O35192

Vmn2r42, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r42O35192 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r42O35192 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r42O35192 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r42O35192 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r42O35192 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r42O35192 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r42O35192 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r42O35192 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r42O35192 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms