Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CckarO08786 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckarO08786 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CckarO08786 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckarO08786 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckarO08786 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckarO08786 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckarO08786 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckarO08786 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CckarO08786 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CckarO08786 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CckarO08786 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CckarO08786 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckarO08786 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CckarO08786 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CckarO08786 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CckarO08786 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CckarO08786 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CckarO08786 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CckarO08786 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CckarO08786 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CckarO08786 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CckarO08786 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CckarO08786 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CckarO08786 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CckarO08786 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CckarO08786 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CckarO08786 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CckarO08786 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CckarO08786 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CckarO08786 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CckarO08786 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CckarO08786 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckarO08786 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckarO08786 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckarO08786 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckarO08786 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckarO08786 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckarO08786 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckarO08786 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckarO08786 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckarO08786 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckarO08786 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckarO08786 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CckarO08786 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckarO08786 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CckarO08786 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckarO08786 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckarO08786 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CckarO08786 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckarO08786 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckarO08786 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckarO08786 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckarO08786 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckarO08786 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckarO08786 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckarO08786 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckarO08786 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckarO08786 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckarO08786 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckarO08786 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckarO08786 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckarO08786 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckarO08786 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckarO08786 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckarO08786 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CckarO08786 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckarO08786 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckarO08786 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckarO08786 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckarO08786 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckarO08786 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckarO08786 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckarO08786 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckarO08786 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckarO08786 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CckarO08786 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckarO08786 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckarO08786 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckarO08786 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckarO08786 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CckarO08786 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CckarO08786 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckarO08786 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms