Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna4O08542 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna4O08542 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna4O08542 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna4O08542 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna4O08542 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna4O08542 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna4O08542 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna4O08542 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna4O08542 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna4O08542 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna4O08542 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna4O08542 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna4O08542 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Efna4O08542 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna4O08542 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna4O08542 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna4O08542 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efna4O08542 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.5 ms