Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Ccdc180J3QNE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC46■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Ccdc180J3QNE4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.94
Ccdc180J3QNE4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Ccdc180J3QNE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Ccdc180J3QNE4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
Ccdc180J3QNE4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Ccdc180J3QNE4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Ccdc180J3QNE4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Ccdc180J3QNE4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Ccdc180J3QNE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Ccdc180J3QNE4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
Ccdc180J3QNE4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Ccdc180J3QNE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC45.69■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
Ccdc180J3QNE4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Ccdc180J3QNE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Ccdc180J3QNE4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC45.53■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Ccdc180J3QNE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Ccdc180J3QNE4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc180J3QNE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc180J3QNE4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Ccdc180J3QNE4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Ccdc180J3QNE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Ccdc180J3QNE4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Ccdc180J3QNE4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Ccdc180J3QNE4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Ccdc180J3QNE4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Ccdc180J3QNE4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc180J3QNE4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ccdc180J3QNE4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Ccdc180J3QNE4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms