Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
5830473C10RikF8VQ07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
5830473C10RikF8VQ07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5830473C10RikF8VQ07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
5830473C10RikF8VQ07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
5830473C10RikF8VQ07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
5830473C10RikF8VQ07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
5830473C10RikF8VQ07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms