Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp9yF8VPU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp9yF8VPU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp9yF8VPU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp9yF8VPU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp9yF8VPU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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