Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20538F6Z9R1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms