Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Plekhg1F6S200 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Plekhg1F6S200 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Plekhg1F6S200 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Plekhg1F6S200 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Plekhg1F6S200 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Plekhg1F6S200 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Plekhg1F6S200 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.81■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Plekhg1F6S200 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Plekhg1F6S200 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Plekhg1F6S200 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Plekhg1F6S200 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Plekhg1F6S200 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Plekhg1F6S200 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms