Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Phldb3E9QAF4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Phldb3E9QAF4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Phldb3E9QAF4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Phldb3E9QAF4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Phldb3E9QAF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Phldb3E9QAF4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phldb3E9QAF4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms