Protein–RNA interactions for Protein: E9PVI0

Vmn2r34, Vomeronasal 2, receptor 34, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r34E9PVI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn2r34E9PVI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r34E9PVI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r34E9PVI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r34E9PVI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r34E9PVI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r34E9PVI0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r34E9PVI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r34E9PVI0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r34E9PVI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms