Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm6133B2RY53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm6133B2RY53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gm6133B2RY53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6133B2RY53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6133B2RY53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm6133B2RY53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm6133B2RY53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm6133B2RY53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm6133B2RY53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm6133B2RY53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm6133B2RY53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm6133B2RY53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms