Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprbB2RU80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprbB2RU80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprbB2RU80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprbB2RU80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprbB2RU80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprbB2RU80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprbB2RU80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprbB2RU80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprbB2RU80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprbB2RU80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprbB2RU80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms