Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor2A7M7C7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skor2A7M7C7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Skor2A7M7C7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Skor2A7M7C7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Skor2A7M7C7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skor2A7M7C7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skor2A7M7C7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Skor2A7M7C7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Skor2A7M7C7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms