Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap29-1A2A5X4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krtap29-1A2A5X4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krtap29-1A2A5X4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms