Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933424G06RikA0A140LIP3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933424G06RikA0A140LIP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933424G06RikA0A140LIP3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms