Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3Q99NH2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3Q99NH2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3Q99NH2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms