Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHLDB3Q6NSJ2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms