Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb10O35955 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Psmb10O35955 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb10O35955 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb10O35955 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb10O35955 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb10O35955 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Psmb10O35955 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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