Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn19Q9ET38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn19Q9ET38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms