Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Cldn19Q9ET38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cldn19Q9ET38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cldn19Q9ET38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cldn19Q9ET38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cldn19Q9ET38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cldn19Q9ET38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cldn19Q9ET38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Cldn19Q9ET38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Cldn19Q9ET38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cldn19Q9ET38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cldn19Q9ET38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Cldn19Q9ET38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cldn19Q9ET38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Cldn19Q9ET38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Cldn19Q9ET38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Cldn19Q9ET38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cldn19Q9ET38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cldn19Q9ET38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cldn19Q9ET38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cldn19Q9ET38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cldn19Q9ET38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cldn19Q9ET38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cldn19Q9ET38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cldn19Q9ET38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cldn19Q9ET38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Cldn19Q9ET38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cldn19Q9ET38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cldn19Q9ET38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cldn19Q9ET38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cldn19Q9ET38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cldn19Q9ET38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cldn19Q9ET38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cldn19Q9ET38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cldn19Q9ET38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cldn19Q9ET38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cldn19Q9ET38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cldn19Q9ET38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cldn19Q9ET38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cldn19Q9ET38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cldn19Q9ET38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cldn19Q9ET38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cldn19Q9ET38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cldn19Q9ET38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn19Q9ET38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cldn19Q9ET38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cldn19Q9ET38 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cldn19Q9ET38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cldn19Q9ET38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cldn19Q9ET38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cldn19Q9ET38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cldn19Q9ET38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cldn19Q9ET38 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cldn19Q9ET38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn19Q9ET38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cldn19Q9ET38 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cldn19Q9ET38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Cldn19Q9ET38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cldn19Q9ET38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cldn19Q9ET38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cldn19Q9ET38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cldn19Q9ET38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cldn19Q9ET38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cldn19Q9ET38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cldn19Q9ET38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cldn19Q9ET38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cldn19Q9ET38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cldn19Q9ET38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cldn19Q9ET38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cldn19Q9ET38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cldn19Q9ET38 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cldn19Q9ET38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn19Q9ET38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cldn19Q9ET38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cldn19Q9ET38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cldn19Q9ET38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn19Q9ET38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cldn19Q9ET38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cldn19Q9ET38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cldn19Q9ET38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cldn19Q9ET38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cldn19Q9ET38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cldn19Q9ET38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cldn19Q9ET38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cldn19Q9ET38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cldn19Q9ET38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cldn19Q9ET38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cldn19Q9ET38 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cldn19Q9ET38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cldn19Q9ET38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cldn19Q9ET38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cldn19Q9ET38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cldn19Q9ET38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cldn19Q9ET38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cldn19Q9ET38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cldn19Q9ET38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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