Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mre11Q61216 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mre11Q61216 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms