Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 RPS17AYML024W 411 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 PEP12YOR036W 867 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 PMD1YER132C 5262 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 UTP8YGR128C 2142 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 SLY41YOR307C 1362 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 RVS161YCR009C 798 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 WIP1YDR374W-A 270 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 RDN58-1RDN58-1 158 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 RDN58-2RDN58-2 158 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 COS1YNL336W 1146 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 SYO1YDL063C 1863 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 URA5YML106W 681 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 PNT1YOR266W 1272 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YMR320WYMR320W 306 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YPR146CYPR146C 330 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YBR292CYBR292C 372 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 SPB4YFL002C 1821 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 NCE101YJL205C 162 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 SNO1YMR095C 675 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 RTT101YJL047C 2529 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 BUD30YDL151C 582 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 MPO1YGL010W 525 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YGL165CYGL165C 579 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 LSM2YBL026W 288 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YDR340WYDR340W 303 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 SMT3YDR510W 306 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YDR521WYDR521W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YKL162CYKL162C 1209 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YOL035CYOL035C 303 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-NL1Q12112 YCL076WYCL076W 744 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 CDC37YDR168W 1521 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PAU8YAL068C 363 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PAU20YOL161C 363 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 SFG1YOR315W 1041 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YPL073CYPL073C 486 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 RUD3YOR216C 1455 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 SEC21YNL287W 2808 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 CDC10YCR002C 969 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 AIM11YER093C-A 414 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 RPL11BYGR085C 525 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YNL043CYNL043C 321 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 RPL11AYPR102C 525 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 ECM18YDR125C 1362 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 VAM6YDL077C 3150 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 BUL2YML111W 2763 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 DPP1YDR284C 870 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 UBC7YMR022W 498 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 CMC4YMR194C-B 222 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 THI80YOR143C 960 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 AI2Q0055 2565 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YML084WYML084W 309 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YOR218CYOR218C 420 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 IRA2YOL081W 9240 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 RSM22YKL155C 1887 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 TFA2YKR062W 987 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YNL184CYNL184C 327 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 HNT3YOR258W 654 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 BRO1YPL084W 2535 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 FIG2YCR089W 4830 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 DBF20YPR111W 1695 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 SPO24YPR036W-A 204 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 SKO1YNL167C 1944 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 BRE5YNR051C 1548 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PAU3YCR104W 375 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 ARI1YGL157W 1044 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PET130YJL023C 1044 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PEP8YJL053W 1140 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YOR082CYOR082C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 PIN4YBL051C 2007 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-NL1Q12112 YCR007CYCR007C 720 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 YNL114CYNL114C 372 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 HUB1YNR032C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 OST2YOR103C 393 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 BAT1YHR208W 1182 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 YIL059CYIL059C 366 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 AAH1YNL141W 1044 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 YOR093CYOR093C 4947 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 ERD2YBL040C 660 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 GAL7YBR018C 1101 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 GYL1YMR192W 2163 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 PLM2YDR501W 1566 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 COG1YGL223C 1254 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 YGR050CYGR050C 357 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-NL1Q12112 IAH1YOR126C 717 nt1.13□□□□□ -2.23
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