Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD3Q9UJU5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD3Q9UJU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms