Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc27A2A6Q5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc27A2A6Q5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms