Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gps1Q99LD4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gps1Q99LD4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms