Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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PTP4A2Q12974 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTP4A2Q12974 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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