Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mid1ip1Q9CQ20 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms