Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEST4Q8NFU0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms