Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms