Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdfS4R2K0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdfS4R2K0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdfS4R2K0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdfS4R2K0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdfS4R2K0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms