Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccne2Q9Z238 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccne2Q9Z238 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccne2Q9Z238 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccne2Q9Z238 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccne2Q9Z238 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccne2Q9Z238 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccne2Q9Z238 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccne2Q9Z238 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccne2Q9Z238 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccne2Q9Z238 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccne2Q9Z238 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms