Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stk39Q9Z1W9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stk39Q9Z1W9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stk39Q9Z1W9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stk39Q9Z1W9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stk39Q9Z1W9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Stk39Q9Z1W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stk39Q9Z1W9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stk39Q9Z1W9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Stk39Q9Z1W9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms